解读Cell | 肠道细菌与病毒的作用，揭示小儿腹泻主要病原体“轮状病毒” 潜在的防控新方法

比起于菌株，人类对于大肠杆菌大肠杆菌治疗防御紧急措施正因如此，对于大肠杆菌大肠杆菌比如说促生素的有效治疗方式还没有被找到。菌株举例来说被显然对压抑大肠杆菌大肠杆菌没有亲密关系。但特定的大肠杆菌，比如噬菌体可以风化效用菌株蛋白。在机体被风化效用的操作过程中，如果不造就抵促功能，在光阴的进化操作过程中违背绝非，或就会被自然选择排除，但我们对于菌株是如何抵促大肠杆菌大肠杆菌研究工作有限。流行性感冒（Rotavirus，RV）是一种非包膜的双链RNA（dsRNA）大肠杆菌，即使如此是在世界上范围的主要病害，每年造成数十万儿童出现危及生命的消化不良，也是造成病及新生儿消化不良的最主要菌株。RV 从口进入人体，主要大肠杆菌肠胃上皮蛋白，这些蛋白不存在于一个统称之为小肠有机体集合起来的大型多样性中。小肠有机体集合起来可预防致病菌。例如，促生素妥善处理的菌株极易被菌株菌株侵殖和患病。这种侵殖涡流被显然总缘了特定菌株家族避免特定类别的菌株的控制能力。然而，有机体集合起来对小肠大肠杆菌大肠杆菌的影响程度极为很清楚。2019年10月10日，佐治亚州立大学Andrew T. Gewirtz博士团队（一作为石振达博士）在Cell时尚杂志上以作序形式刊出了文章Segmented Filamentous Bacteria Prevent and Cure Rotavirus Infection，研究工作了小肠菌株有机体对流行性感冒大肠杆菌的影响。Rag1-knockout（KO）血清，与患上严重水痘的人类一样，它们一旦被RV大肠杆菌，就就会蓬勃发展为慢性RV大肠杆菌。在将Rag1-KO血清用于研究工作时，我们无意间找到了一株对RV大肠杆菌不具备高度抵促力的Rag1-KO血清。我们阿贝尔这些血清得到了特定有机体集合起来，这赋予了菌株RV的促性。我们找到它们的RV促性与固有免疫球蛋白（ILC）毫无关系，也不需要类似物（IFN），它们对于压制大多数大肠杆菌至关重要。相反，这些血清对RV促性是由分段丝状菌株（segmented filamentous bacteria，SFB）介导的，这种菌株在避免或治好RV大肠杆菌的方向上改变了RV和菌株回肠，这暗示一种一新功能，通过这种功能，小肠有机体集合起来可以改善健康。事实上，我们找到通过对富含SFB的小肠有机体集合起来的植入，接受植入的血清降到了“百毒不侵”的平衡状态，对多种小肠大肠杆菌和菌株产生了促性。缘 果1. 可散播的有机体确保水痘和有致病控制能力的血清防止流行性感冒大肠杆菌我们将RV-易感Rag1-KO血清称之为"JAX-RAG"，将上述促RV的Rag1-KO血清称之为"GSU-RAG"。将JAX-RAG和GSU-RAG血清摆放在同一笼子或从GSU-RAG中植入出小肠有机体集合起来，造成JAX-RAG血清得到RV耐性。植入GSU-RAG小肠有机体到未成熟（Germ free，GF） Rag1-KO血清中产生了对RV实际上促性，而接受JAX-RAG有机体集合起来的GF Rag1-KO血清蓬勃发展为慢性RV大肠杆菌，解释植入的小肠菌集合起来可以实际上确保菌株，而同样菌株本身的菌集合起来做出功绩。此外，对不具备慢性RV大肠杆菌的JAX-RAG血清展开GSU-RAG小肠有机体集合起来（而不是JAX-RAG的）植入，造成RV促原扣留停止，得出缘论慢性RV大肠杆菌的治好。哺乳期RAG幼崽与RV的大肠杆菌造成水性消化不良。RV 引起的消化不良依然被 GSU-RAG 消除，但JAX-RAG 粪不能做到。非常多的是，致病染色和PCR对回肠内RV基因组的定量确认没有RV大肠杆菌。类似地，植入GSU-RAG小肠有机体到不具备完善致病系统的野生（WT）血清，使菌株得到了对RV的促性。在成年WT血清上，这种确保性与植入后RV大肠杆菌的早晚有关。在植入GSU-RAG小肠有机体后两日内对其展开RV大肠杆菌，菌株就会被实际上确保，不就会被大肠杆菌；然而7日后展开大肠杆菌，菌株只就会被部分确保。在幼年WT血清（1周和3周）上，展开植入和RV大肠杆菌，实际上的RV确保性就会产生，比如水样消化不良依然就会被实际上变成。2. 便是确保功能以及起极其重要促大肠杆菌的有机体我们想法了中和植入可能造成菌株产生的促大肠杆菌因子，比如IL-22，IFN-，但促大肠杆菌效用并未变成。我们还想法了便是其他小肠致病蛋白对这个促大肠杆菌现象的功绩，通过运用固有免疫球蛋白缺少的血清，以及便是致病蛋白的数目变化，并且展开植入小肠致病蛋白，但这些实验都得出缘论，这些致病因子和致病蛋白对于这个RV促性的表现性功绩有限，因此这种促RV 大肠杆菌的功能有别于相似促大肠杆菌的功能。固有免疫球蛋白缺少（ILC）的血清，这株血清没有T蛋白、B蛋白和NK蛋白；粒蛋白、巨噬蛋白和突出蛋白数目都有微小增加。这样在这株血清菌株母体剩余的致病蛋白，以及促大肠杆菌的功能现在很有限了。我们研究工作了GSU-RAG有机体是否是有控制能力在体内增高RV大肠杆菌控制能力。缘果格兰德，从粪中漂白出的小肠菌集合起来可以在没有致病蛋白的条件下增加RV大肠杆菌，并且这种促大肠杆菌效用不仅以外RV，但延伸到其他大肠杆菌，包括VSV，IAV，和reo大肠杆菌都被相同程度的，在母体和体内，增加了毒力。对小肠菌集合起来展开体内结合促生素妥善处理，而不是结合促真菌妥善处理，这种促RV的确保效用随之变成，断定极其重要促大肠杆菌有机体对促生素敏感。随后非常具体情况的促生素妥善处理得出缘论，极其重要促大肠杆菌的有机体对卡那霉素耐受。通过对不具备RV抵促性的有机体集合起来加热、漂白和促生素的妥善处理，然后溶解并植入到无菌株血清，最终展开有机体集合起来落分析。这种方式得出缘论，一株一新分段丝状菌株（SFB）不存在于被植入并且产生RV抵促性的血清小肠内。这株SFB占被植入血清小肠菌株总量超过95%，并且它足以使血清对RV大肠杆菌和之外消化不良产生促性。通过基因测序，RV大肠杆菌测试，小肠切片染色，植入GSU-RAG结合小肠菌集合起来和这株SFB可以造成比如说的菌株表型，包括小肠上皮蛋白发炎，小肠介导的改变。这种肠上皮发炎现在被显然和促小肠病原有机体大肠杆菌有密切亲密关系。总 缘流行性感冒与多种有机体集合起来共生在小肠上皮蛋白，从而打开有机体影响 RV大肠杆菌的可能。虽然清理RV举例来说需要可操作性致病，但我们无意间找到了促RV水痘的血清，而举例来说来说清理大肠杆菌大肠杆菌紧紧依赖于致病系统，而水痘的菌株难于清理大肠杆菌大肠杆菌，从而被大肠杆菌慢性大肠杆菌，乃至终生被大肠杆菌。我们假设，这种RV促性总缘了抵促RV大肠杆菌的有机体的不存在。具体情况的是，这种RV抵促性可通过共宿和粪植入来散播。这种确保效用与之前定义的RV阻促因素毫无关系，包括固有致病蛋白ILCs，类似物、IL-17和IL-22。SFB在回肠的定植诱导菌株介导的变化，并加速上皮蛋白周转。掺入SFB的粪与RV共同孵育，增高了RV体内大肠杆菌率，解释了了直接中和RV效用的可能。因此，独立于致病蛋白，SFB提供确保某些小肠大肠杆菌大肠杆菌和之外消化不良病。原始出处：ZhendaShi1,JunZou1,ZhanZhang1,et al.Segmented Filamentous Bacteria Prevent and Cure Rotavirus Infection.Cell.10 October 2019，